Фамилия Шаканова — женская форма, образованная от мужской фамилии Шаканов. Основа фамилии — прозвище или тюркское имя Шакан. В русской ономастике фамилии, оканчивающиеся на -ов/-ев, — самая распространённая модель, которая указывает на принадлежность: «чей сын?» — Шаканов. Суффикс -ов здесь стандартный, без редких черт.

Корень «Шака» имеет несколько возможных источников. Самая прямая версия — от тюркского слова «шак» или «шака», что в ряде языков (казахском, киргизском, татарском) означает «шакал» или «хищник». В таком случае прозвище Шакан могли дать человеку с острым слухом, хитростью или внешним сходством с этим зверем. Однако в тюркской антропонимике часто встречаются имена-обереги, образованные от названий животных, чтобы отпугнуть злых духов. Шакан могло быть именно таким охранительным именем.

Вторая версия — от арабского имени Шакир (благодарный) или Шакиржан, которое в народной речи могло редуцироваться до Шакан. Такие сокращения типичны для тюркских фамилий, особенно в Поволжье и Средней Азии. Третья, менее вероятная, — от русского слова «шакал» через заимствование, но это скорее позднее и случайное совпадение.

Географически фамилия Шаканов (и Шаканова) чаще всего встречается среди тюркоязычных народов России: в Татарстане, Башкортостане, а также у казахов. В дореволюционных метрических книгах она могла записываться с вариантами: Шакановъ, Шаканав. Сословная принадлежность предков — преимущественно крестьяне или казаки, поскольку дворянские роды с такой фамилией не фиксируются в известных родословных сборниках.

Интересная деталь: в некоторых диалектах казахского языка слово «шакан» означает «маленький, юркий» — это могло стать прозвищем для подвижного ребёнка. Таким образом, фамилия Шаканова несёт в себе не столько зоологический оттенок, сколько бытовую характеристику человека из тюркской среды, жившего несколько столетий назад.