Фамилия Шахура — редкий случай, когда она не вписывается в стандартную русскую модель на -ов/-ев или -ин. Её окончание -а при мужском варианте (Шахура, а не Шахурин) сразу указывает, что перед нами не исконно русская фамилия, а скорее украинская, белорусская или польская по происхождению. В этих языках фамилии на -а без дополнительных суффиксов — обычное дело. Если бы фамилия была русской, её бы со временем переоформили в Шахурин, но этого не произошло.

Основа фамилии восходит к прозвищу или личному имени. Самый вероятный источник — тюркское слово «шахур» или «шахур», которое в некоторых диалектах означает «крикун», «горлопан» или «хвастун». В тюркских языках «шах» — это «царь» или «владыка», но с добавлением суффикса -ур значение смещается в сторону человека, который ведёт себя как царь, то есть заносчивого или шумного. Такое прозвище могли дать человеку с громким голосом или склонному к бахвальству.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с арабским именем Шахур, которое встречается у народов, исповедующих ислам. В этом случае Шахура — это не прозвище, а патроним, то есть «сын Шахура». Такое имя могло попасть в славянскую среду через татар или других тюркоязычных соседей, особенно в южнорусских и украинских землях, где контакты с кочевниками были плотными.

Географически фамилия Шахура чаще всего встречается в западных областях Украины и в Беларуси. В России она редка и, как правило, принадлежит потомкам переселенцев из тех регионов. Суффиксальная модель (отсутствие суффикса) и корень указывают, что предки носителя фамилии — не дворяне и не духовенство, а скорее крестьяне или казаки, получившие прозвище за свой характер или внешность.

Сравните с однокоренными фамилиями: Шахурин (русифицированный вариант), Шахурский (польский или белорусский вариант с суффиксом принадлежности), Шахур (чисто тюркская форма). Шахура стоит особняком — это наиболее архаичная и прямая форма, не изменённая позднейшими канцелярскими переделками.