Фамилия Шалакитский — редкая, и её происхождение неочевидно даже для специалиста по русским фамилиям. С первого взгляда она кажется типичной «географической» фамилией на -ский, которую обычно получали выходцы из какого-то места. Однако топоним «Шалакитский» или «Шалакиты» не зафиксирован на современных картах, и это заставляет искать другие пути образования.

Наиболее вероятная версия — фамилия происходит от прозвища Шалакит. Основа «шалак-» или «шалакш-» может быть связана с диалектным словом «шалакша» — так в некоторых северных говорах называли шумного, беспокойного человека или пустомелю. Слово имеет финно-угорский оттенок и встречается в архангельских и вологодских говорах. Если это так, то Шалакит — человек с неспокойным нравом, а суффикс -ит (как в фамилиях Косит, Летит) мог выполнять роль прозвищного форманта, указывая на носителя признака. Фамилия образована по модели «прозвище + суффикс -ский», что в XVII–XIX веках нередко делали для придания фамилии «благородного» звучания — так крестьяне или мещане могли «подтянуть» свою фамилию под дворянский стандарт.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с литовским или польским корнем. В польском языке есть слово «szałak» (шалаш, лачуга), а суффикс -icki характерен для польских фамилий. Однако написание через «а» (Шалакитский, а не Шалакицкий) и отсутствие фамилии в польских ономастиконах склоняют к первой версии.

В церковных книгах и ревизских сказках XIX века фамилия почти не встречается. Это говорит о том, что она могла быть локальной — бытовать в одной-двух деревнях или среди небольшой группы старообрядцев. Сословно предки Шалакитских, скорее всего, были государственными крестьянами или однодворцами южных губерний России, где часто встречаются фамилии на -ский у недворянского населения.

Фамилия стоит особняком среди однокоренных: есть Шалагины, Шалаевы, Шаламовы, но Шалакитский — случай уникальный, с редким суффиксом прозвища и неочевидной географией.