Фамилия Шалапинина — женская форма, образованная от мужской Шалапинин. В основе лежит прозвище или мирское имя Шалапа (Шалап). Чтобы понять, что оно означало, нужно разобраться с самим корнем. В русских говорах слово «шалапай» или «шалапа» имело уничижительное значение: так называли нерасторопного, несерьёзного человека, разину, а иногда и просто повесу. В словаре Владимира Даля «шалапай» — это «шатун, шленда, пустомеля». Есть и более безобидное толкование: в некоторых регионах «шалапой» могли назвать неуклюжего, мешковатого человека.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шалапинин буквально означало «сын Шалапы» или «человек из рода Шалапы». Форма на -инин (с двойным «и») в русских фамилиях встречается реже, чем просто -ин, но встречается: например, Дружинин, Гаврилин. В случае Шалапинина второй суффикс -ин мог появиться из-за того, что основа Шалапа уже оканчивалась на -а, и фамилию строили по модели «чей?» — Шалапин, а затем, по аналогии с другими отчествами, добавили ещё один -ин, закрепив форму Шалапинин. Впрочем, не исключено, что исходное прозвище звучало как Шалапина (с ударением на второй слог), и тогда фамилия — прямое указание на жену или вдову Шалапы, но для русских фамилий классическая модель патронимическая, а не матримониальная.

География фамилии неширокая. Шалапинины встречаются преимущественно в центральных и северных областях России: в Вологодской, Костромской, Кировской областях, а также в Пермском крае. Это согласуется с диалектной природой слова «шалапа» — оно бытовало именно в северных и северо-восточных говорах. В южных и западных регионах фамилия редка, что подтверждает её локальное происхождение.

Сословно Шалапинины — почти наверняка крестьянская или мещанская фамилия. Прозвища с отрицательной или ироничной окраской чаще закреплялись за простыми людьми, а не за дворянством. В ревизских сказках XVIII–XIX веков носители фамилии фигурируют как государственные или помещичьи крестьяне. Дворянских родов Шалапининых не зафиксировано.

Однокоренные фамилии — Шалапин, Шалапаев, Шалапов, Шалапанов. Все они образованы от одного корня, но с разными суффиксами. Шалапинин стоит в этом ряду особняком из-за двойного -ин, что делает её более редкой и узнаваемой.