Фамилия Шалунова образована от прозвища Шалун, которое восходит к аналогичному нарицательному со значением «тот, кто шалит, резвится, проводит время в проказах». Скорее всего, таким прозвищем родители называли своих непослушных детей — проказников, сорванцов, баловников. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шалун, со временем получил фамилию Шалунова.