Фамилия Шанбуров — редкий случай, когда основа не бросается в глаза даже носителю языка. Если отбросить типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?»), остаётся корень «Шанбур». В нём отчётливо слышится тюркское или иранское звучание, и это главный ключ к происхождению.

Скорее всего, в основе лежит сложное имя или прозвище из двух частей: «шан» и «бур». В тюркских языках «шан» может означать «слава», «известность» (ср. татарское «шан» — честь, почёт). Вторая часть «бур» восходит к древнетюркскому «бöри» — «волк». У многих тюркских народов, особенно у башкир и казахов, волк — тотемное животное, символ силы и воинской доблести. Имя Шанбур в таком случае означало бы «Прославленный волк» или «Волк чести». Это вполне реальная антропонимическая модель: личное имя, которое позже стало фамилией.

Менее вероятна, но возможна связь с географическим названием. В Западном Казахстане есть река Шанбур (приток Урала), а в Оренбургской области — село Шанбурово. Предок мог получить фамилию по месту жительства: «Шанбуров» — тот, кто родом с берегов реки Шанбур или из одноимённого села. Однако для русской ономастики характернее сначала прозвище или имя, а уже потом — топоним от него, а не наоборот.

Фамилия явно недворянская и не священническая (там преобладали бы окончания -ский или греческие корни). Шанбуровы — это, скорее всего, потомки служилых людей, казаков или крестьян, живших на юго-восточных рубежах России, в зоне контакта с тюркскими народами. Фамилия могла закрепиться за русским, получившим тюркское прозвище, или за обрусевшим татарином, башкиром, ногайцем. География фамилии (Оренбуржье, Башкирия, Челябинская область) это подтверждает.

Встречается вариант написания Шанбуров, хотя ударение, скорее всего, падает на второй слог: Шанбу́ров. Однокоренных фамилий в русском языке практически нет, что делает Шанбурова уникальным ономастическим следом — скорее всего, от конкретного личного имени, которое не превратилось в массовое.