Фамилия Шарафханов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Шарафханов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Шарафханов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Шарафханов образована от арабо-тюркского мужского имени Шарафхан. Оно восходит к двум основам: первая из них, «шараф», в переводе с арабского означает «честь, почет, слава», «высшая степень, высший ранг», «благородство, знатность, аристократизм». Вторая часть, тюркское слово «хан», переводится как «повелитель, властелин». Соответственно, имя Шарафхан можно перевести как «великий, благородный правитель». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Шарафханов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Шарафханов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.