Фамилия Шатарнин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а, скорее всего, местное прозвище, связанное с диалектным словом. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать суффиксальную модель и корень, который неочевиден на первый взгляд.

Фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: «чей?» — Шатарнин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Шатарня. Основа «шатарн-» — это усечённый вариант от «шатарь» или «шатара». В русских говорах (особенно северных и сибирских) словом «шатарь» называли бродягу, шатуна, человека, который «шатается» без дела. Глагол «шатать» в переносном смысле дал прозвище непоседе или тому, кто часто менял место жительства. Суффикс -н- в основе мог появиться как вариант словообразования: «шатать» → «шатарня» (действие или объект, связанный с шатанием).

Версия с тюркским корнем (например, от «шатыр» — палатка, шатёр) маловероятна, потому что фамилия имеет прозрачную славянскую словообразовательную цепочку и не встречается у народов, где такие корни типичны. Унбегаун в своём словаре разбирает похожие модели с глагольными основами, указывая, что фамилии на -ин от прозвищ, обозначающих характер или поведение, были распространены в крестьянской среде.

Географически фамилия Шатарнин встречается крайне редко, но её очаги — в Пермском крае и Кировской области, где диалектное слово «шатарь» было в ходу. Это косвенно подтверждает, что предки носителя фамилии могли быть крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище за беспокойный нрав или склонность к перемене мест. Никаких документальных сведений о дворянском происхождении или принадлежности к известным родам нет — это фамилия из низовой народной среды, где прозвище закреплялось за родом через поколение.