Фамилия Шатухина — женская форма фамилии Шатухин. Её основа — прозвище Шатуха, которое в русских говорах имело несколько значений. Самое вероятное: шатуном или шатухой называли человека, который любит бродить без дела, слоняться по дворам, не сидеть на месте. В некоторых регионах слово «шатуха» означало «гуляка», «повеса». Слово образовано от глагола «шататься», то есть ходить без определённой цели.

Менее распространённая, но возможная версия связывает прозвище с медведем-шатуном — зверем, который не залёг в спячку и бродит по лесу злым и опасным. Так могли прозвать человека с тяжёлым, неуживчивым характером или того, кто вёл беспокойный образ жизни. В пользу этой версии говорит то, что прозвища по поведению животного в русской ономастике встречаются часто (Волк, Лиса, Медведь).

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шатухин — «сын Шатухи» или «человек из рода Шатухи». Такая модель типична для северных и центральных областей России. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская: прозвища давали в среде простых людей, и они часто закреплялись за потомками в качестве фамилии.

Интересная деталь: фамилия Шатухин (и Шатухина) довольно редкая. Она не входит в число распространённых русских фамилий, что говорит о локальном бытовании прозвища. Встречается преимущественно в Поволжье и на Урале — в тех местах, где слово «шатуха» в значении «бродяга» или «непоседа» было в ходу до XX века. Однокоренные фамилии — Шаталов, Шатунов, Шатуновский — образованы от того же корня, но с разными суффиксами, что показывает вариативность народной словообразовательной модели.