Фамилия Щипкины образована по стандартной для русских фамилий модели: к основе «Щипк-» добавили суффикс принадлежности «-ин», который отвечает на вопрос «чей?». Буквально Щипкин — это «тот, кто относится к Щипке», то есть сын, внук или слуга человека по прозвищу Щипка. Суффикс «-ин» в русских фамилиях обычно присоединялся к основам на «-а» или «-я», что как раз и указывает на исходную форму прозвища — Щипка.

Корень «щип-» прозрачен и отсылает к глаголу «щипать». В русских говорах слово «щипка» имело несколько значений. Самое очевидное — это действие, но в качестве прозвища Щипкой могли назвать человека с мелким, придирчивым характером, того, кто «щиплет» окружающих мелкими замечаниями или скупостью. Второе, не менее вероятное значение — ремесленное: щипками называли инструменты для захвата и выдёргивания, например, кузнечные клещи или щипцы для свечей. Поэтому прозвище мог получить мастеровой, работающий с таким инструментом, — кузнец, жестянщик или даже парикмахер (в старину цирюльники тоже работали щипцами).

Встречается и более конкретный вариант: в некоторых регионах «щипкой» называли птицу, которая клюёт зёрна, то есть «щиплет» корм. Это могло стать прозвищем для запасливого или суетливого человека. Есть и третья, более тёмная версия: связь со словом «щипок» — вор, карманник, который «щиплет» кошельки. Однако она менее распространена в ономастике, и для фамилии Щипкины она скорее гипотетическая, чем доказанная.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России, где суффикс «-ин» исторически преобладал. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с этой фамилией, но конкретных известных носителей, вошедших в энциклопедии, нет — это рядовая, но нередкая фамилия, которая сохранила память о прозвище предка, его характере или занятии.