Фамилия Шегушева — женская форма, а мужской вариант Шегушев. Сразу бросается в глаза необычное звучание: корень «шегуш» не похож на типичные славянские основы. И это не случайно: перед нами фамилия тюркского происхождения, скорее всего, из волго-уральского региона.

В основе лежит тюркское слово «шегуш» (или близкие к нему «шигуш», «чигуш»), которое в разных диалектах означало либо «чибис» (птица из семейства ржанковых), либо «крикун», «горлопан». Прозвище Шегуш могли дать человеку с громким голосом или, в переносном смысле, суетливому, беспокойному. Вторая, менее вероятная версия, возводит основу к татарскому «шигыш» — «восток». В этом случае прозвище могло указывать на восточное происхождение носителя или место жительства к востоку от поселения.

Модель образования простая: к основе «Шегуш» добавили типичный русский суффикс принадлежности «-ев» (фонетический вариант «-ов» после мягкой шипящей). Так из прозвища отца сделали фамилию его потомков. В русской традиции фамилии на «-ев» чаще всего означали «чей?» — то есть «сын Шегуша». Географически фамилия Шегушевы встречается преимущественно в Поволжье, особенно в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области. Там же распространены однокоренные фамилии Шигушев, Чигушев, а также более редкие Шегуров и Шегур.

В сословном отношении предки Шегушевых, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами. В XVIII–XIX веках в этих краях активно шла христианизация и русификация тюркского населения, и тюркские прозвища, переходя в фамилии, закреплялись в русской форме. Никаких документальных упоминаний о дворянском происхождении Шегушевых нет — фамилия осталась в крестьянской и мещанской среде.