Фамилия Шемарулина — женская форма, а её основа — мужская фамилия Шемарулин. В русской ономастике это редкий случай, когда суффикс -ин указывает на принадлежность, но сама модель образования нестандартна. Обычно фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я (Иванов → Иванин), но здесь мы видим основу «Шемарул». Это говорит о том, что исходное прозвище или имя звучало как Шемаруля, а фамилия по отцу закрепилась в форме Шемарулин (чей? — Шемарулин сын). То есть предок носителя фамилии был известен под прозвищем Шемаруля.

Корень «шем-» в русских говорах и фамилиях часто связан с диалектным словом «шема» (щека, скула) или «шемяга» (худой, тощий). В словаре В. Даля «шема» — это не только щека, но и бранное прозвище для худого человека. Однако вторая часть «-рул» нехарактерна для славянских основ. Здесь возможна тюркская версия: в татарском, башкирском и других тюркских языках есть имя Шамарул (от арабского «шамар» — охранять, или «шам» — свеча), а суффикс -ин мог прибавиться уже после русификации. В пользу этого говорит и география: фамилия Шемарулин встречается в Поволжье, особенно в Татарстане и Башкирии, где русское население веками соседствовало с тюркским.

По другой, менее правдоподобной версии, основа могла быть переосмыслена как «шема» + «руль» — от слова «рулить» или «руль», но это позднее народное толкование, не подтверждённое историческими записями. Филологически надёжнее считать Шемарулина фамилией тюркского происхождения, адаптированной русским суффиксом принадлежности. В дореволюционных метрических книгах Казанской и Симбирской губерний фамилия фиксируется как у крестьян, так и у мещан, что говорит о её широком бытовании в среднем Поволжье.

Таким образом, носитель фамилии Шемарулин — потомок человека по прозвищу Шемаруля, которое, скорее всего, имело тюркские корни и означало что-то вроде «охранник» или «свечеподобный». Фамилия редкая, не входит в топ-1000, но её история — пример того, как на стыке культур рождаются неожиданные словообразовательные модели.