Фамилия Шембергер образована от аналогичного прозвища, восходящего к топониму Шемберг. Так называется ряд населенных пунктов в Тюрингии и Баден-Вюртемберге в Германии. Компонент –ер представляет собой суффикс принадлежности, который часто используется при образовании немецких фамилий. Так могли назвать выходца из Шемберга и его окрестностей.