Фамилия Шепея — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, без типичных фамильных суффиксов вроде -ов или -ин. В русской традиции такие «голые» основы характерны для украинской или белорусской среды, хотя встречаются и в южнорусских говорах. По сути, перед нами не что иное, как застывшее прозвище, которое дали человеку по характерной черте.

Основа — слово «шепелявый», то есть человек с шепелявой речью, картавый или нечисто выговаривающий свистящие и шипящие. В диалектах «шепея» могло означать и просто «заика» или «бормотун». Прозвища по дефектам речи давали охотно и повсеместно — так появились Шепель, Шепелявый, Шепеленко, а Шепея — более краткая, усечённая форма. Скорее всего, предок носителя фамилии обладал заметной особенностью произношения, которая и закрепилась за ним как родовое имя.

Географически фамилия тяготеет к западу и юго-западу России, а также к Беларуси и Украине. Встречается она редко, что подтверждает её локальный, а не массовый характер. Если ваш предок носил такую фамилию, он мог быть крестьянином или казаком — прозвища по внешним признакам у этих сословий были обычным делом, в отличие от дворянских фамилий, чаще образованных от географических названий или имён.

С точки зрения словообразования, Шепея — это субстантивированное прилагательное или существительное в краткой форме. Сравните с фамилиями Шепель, Шепельский, Шепелевич — все они восходят к тому же корню, но Шепея стоит особняком благодаря окончанию -я, которое придаёт ей оттенок уменьшительности или просторечности. В дореволюционных документах фамилия могла писаться и через «и» — Шепея, но встречалось и написание с «е» после шипящего, что для XIX века было нормой.

Известных носителей фамилии, оставивших яркий след в истории, нет — это рядовая, народная фамилия, не попавшая в энциклопедии. Но именно в этом её ценность: она прямо говорит о том, как в старину люди цепко замечали особенности друг друга и превращали их в фамильные знаки, передаваемые через поколения.