Фамилия Шепинин — одна из тех, где очевидный на первый взгляд корень может оказаться ловушкой. Сразу хочется связать её со словом «щепка» или «щепить», но в русской ономастике есть нюанс: фамилии на -инин, как правило, образуются от прозвищ, оканчивающихся на -иня. То есть в основе лежит не «щепа», а «Щепя» или «Шепя» — уменьшительная форма от того же корня, но с другим суффиксальным оформлением. Модель проста: прозвище Щепя (Шепя) плюс притяжательный суффикс -ин дают Щепин, а форма на -инин указывает на принадлежность к кому-то, кого звали именно Щепя.

Что означало такое прозвище? Скорее всего, оно относилось к человеку худощавого телосложения — «щепка», «щепочка» в переносном смысле. В говорах «щепой» могли назвать и бойкого, вертлявого человека, а в некоторых регионах — того, кто занимался колкой дров или изготовлением щепы (например, для кровли или плетения). Версия с ремеслом менее вероятна: для мастерового человека скорее дали бы прозвище Щепник или Щепарь, а Щепя — это именно ласкательно-пренебрежительное прозвище по внешности или характеру.

Написание через «Ш» — фонетическое. В южнорусских и некоторых среднерусских говорах «щ» произносили твёрдо, как долгое «ш» (ш’ш’), что на письме иногда закреплялось. Поэтому Шепинин и Щепинин — варианты одной фамилии, разошедшиеся по разным ветвям рода. В документах XVII–XVIII веков можно встретить обе формы, и это не ошибка писаря, а отражение живой речи.

Фамилия довольно редкая. По переписям XIX века носители Шепининых встречались в основном в центральных губерниях — Рязанской, Тамбовской, отчасти в Воронежской. Сословно это были преимущественно крестьяне и мещане, реже — однодворцы. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что тоже косвенно подтверждает её прозвищное, а не служилое происхождение.

Искать однокоренные фамилии стоит среди Щепиных, Щепетильниковых, Щепкиных — все они из одного гнезда, но с разными суффиксами и значениями. Шепинин же выделяется тем, что сохранил редкую форму на -инин, которая сегодня почти не даёт новых фамилий.