Фамилия Шершуков образована от прозвища Шершук, в основе которого лежит диалектное слово «шершавый» - «лохматый, косматый, всклоченный». Прозвища с основой Шерш- были очень распространены на Руси, в результате чего от них произошло много родственных фамилий: Шершавин, Шершаков, Шаршавин, Шаршаков. Согласно другой, менее правдоподобной версии, эта фамилия восходит к украинскому слову «шершун» - «шершень». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шершук, со временем получил фамилию Шершуков.