Фамилия Шершун восходит к прозвищу Шершун, восходящего к украинскому слову "шершун", что в переводе на русский язык означает "шершень"(самое большое насекомое из семейства осиных, с жалом). Такое прозвище, предположительно, мог получить резкий, быстрый, острый на язык человек. Согласно другой, менее правдоподобной версии, прозвище связано диалектным словом "шершавый" - "лохматый, косматый, всклоченный". Предположительно, фамилия указывает на внешние особенности предка. Прозвища с основой Шерш- были очень распространены на Руси, в результате чего от них произошло много родственных фамилий: Шершавин, Шершаков, Шаршавин, Шаршаков. Среди самых известных однофамильцев - Богдан Шершун — украинский футболист, защитник днепропетровского «Днепра», играющий на позиции центрального защитника.