Фамилия Шкабурин — одна из тех, где корень сразу бросается в глаза своей редкостью. Она явно образована от прозвища или неканонического имени Шкабура с помощью стандартного русского патронимического суффикса -ин, указывающего на принадлежность («чей?» — «Шкабурин сын»). Вопрос в том, что такое «шкабура».

Скорее всего, в основе лежит диалектное слово. В русских говорах Поволжья и Урала «шкабурой» или «шкабурой» могли называть нечто шершавое, неровное, корявое, а также неопрятного, взлохмаченного человека. В пермских и вятских говорах встречается слово «шкабара» — заскорузлая кожа, струп, нарост на дереве. Таким образом, прозвище Шкабура мог получить человек с грубой кожей, либо неаккуратный, либо, в переносном смысле, упрямый и «колючий» по характеру.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими языками, где есть корни со значением «ранить» или «царапать». Однако для фамилий центральной России и севера такая основа нетипична, и версия с русским диалектным словом выглядит убедительнее.

Географически фамилия Шкабурин тяготеет к Вятке и Пермскому краю — именно в этих регионах зафиксированы ранние упоминания. В списках крестьян Глазовского уезда Вятской губернии встречаются Шкабурины, что подтверждает бытовое, а не служилое происхождение фамилии. Суффикс -ин, а не -ов, тоже говорит о том, что прозвище Шкабура было распространено в северорусской и вятской среде, где этот суффикс преобладал.

Родственные фамилии — Шкабарин, Шкабаров, Шкабурда. Они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами, что указывает на единое гнездо прозвищ, связанных с внешностью или характером. Встречается и вариант Шкабурин с ударением на последний слог, что характерно для некоторых переселенческих говоров Сибири.

Итак, предки носителя фамилии Шкабурин — скорее всего, крестьяне Вятской или Пермской губернии, получившие прозвище за грубоватую внешность или нелюдимый нрав. Фамилия редкая, но её происхождение прозрачно и не требует сложных реконструкций.