Фамилия Шкабурина — женская форма мужской фамилии Шкабурин. В русской традиции такие фамилии образовывались при помощи суффикса -ин, который указывает на принадлежность: Шкабурин буквально означает «сын Шкабуры» или «из семьи Шкабуры». Основа фамилии — прозвище Шкабура.

Корень здесь затемненный и редкий. Правдоподобнее всего версия, что «шкабура» — это диалектное слово, связанное с глаголом «шкабурить» или «шкабулькать». В некоторых говорах русского Севера и Урала так называли человека, который шуршит, возится, делает что-то неспешно или неловко, либо, наоборот, суетливо и с шумом. Встречается и значение «скрести, царапать» — возможно, прозвище дали тому, кто постоянно что-то чистил, скоблил или работал с деревом, снимая кору (ср. «шкабур» — заскорузлый, шершавый).

Менее вероятно, но не исключено, что Шкабура — это фонетический вариант прозвища от слова «скабура» (насмешник, балагур), которое зафиксировано в псковских и тверских говорах. Однако звуковой переход «ск» в «шк» для этих регионов нехарактерен, поэтому версия с действием (возня, скобление) выглядит убедительнее.

Географически фамилия Шкабурин тяготеет к северо-востоку европейской части России и Уралу. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с этой фамилией в Вятской и Пермской губерниях — краях, где диалектная лексика особенно богата. Сословно предки Шкабуриных, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, реже — ремесленниками.

По модели образования фамилия Шкабурин — типичная «семейная» русская фамилия, но с нестандартной основой, что делает её ценной для историков языка. Если ваш предок носил это прозвище, он мог быть человеком с характерной манерой движения или работы — тем, кого в деревне запомнили по звуку: шуршащему, скребущему, негромкому, но узнаваемому.