Фамилия Шкабуро — один из тех случаев, когда прозвище превратилось в фамилию, почти не изменив формы. В ней нет типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на украинское или белорусское происхождение. По сути, перед нами застывшее прозвище, которое так и осталось в именительном падеже.

Корень «шкабур» в восточнославянских говорах имеет несколько значений. Наиболее вероятное — «шкварка», «вытопка сала», то есть то, что остаётся после перетапливания. В этом случае Шкабуро — прозвище либо любителя шкварок, либо человека, который занимался вытопкой сала, возможно, мясника или торговца. В украинском языке есть слово «шква́рка» (шкварка), а «шкварчати» — шипеть при жарке. Форма на -о типична для украинских фамилий, образованных от прозвищ (например, Шевченко, Бойко).

Менее распространённая, но тоже возможная версия связывает основу с диалектным глаголом «шкабурить» — скрести, чистить, скоблить. Тогда прозвище могло относиться к чистоплотному, аккуратному человеку или, наоборот, к тому, кто постоянно что-то скоблил (например, кожевник или бондарь). В пользу этой версии говорит то, что в белорусских говорах «шкабурыць» означает «чесать, царапать».

Географически фамилия Шкабуро встречается прежде всего на западе Украины, в частности в Волынской, Ровенской и Львовской областях, а также в юго-западных районах Беларуси (Брестская область). Это подтверждает её западноукраинские корни. В России фамилия редкая и, скорее всего, принесена мигрантами из этих регионов.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Шкабура, Шкабурин, Шкабуренко) показывает, что все они образованы от одной основы, но с разными суффиксами, что типично для разных диалектных зон. Шкабуро — самый «чистый» вариант, без дополнительных суффиксов, что делает его прозвищную природу особенно заметной.