Фамилия Шкалябина — женская форма от Шкалябин, и её разумнее всего рассматривать в связке с мужским вариантом. Основа здесь — прозвище Шкаляба, которое звучит необычно и требует разбора по частям. Корень «шкал-» в русских говорах имеет несколько значений, и самое вероятное для фамилии — диалектное «шкалить», то есть проказничать, шалить, а также «шутить, зубоскалить». Вторая часть «-яба» — характерный суффикс, который в северных и сибирских говорах придаёт слову оттенок грубоватости или фамильярности (сравните: «зевяка», «кривляка», «разиня»). Таким образом, Шкаляба — это прозвище для человека острого на язык, балагура или, напротив, для того, кто любит подшучивать и проказничать.

Модель образования типична для русских фамилий: от прозвища на -а/-я с помощью патронимического суффикса -ин (чей? — сын Шкалябы). Встречается и вариант Шкалябин, что абсолютно равнозначно. Фамилия редкая, и её география, скорее всего, связана с северными или центральными регионами России, где были живы диалектные формы.

Есть и менее очевидная версия: «шкаляба» могло быть ироничным прозвищем от «шкалик» — старинная мера объёма жидкости, примерно 0,06 литра. Так могли назвать человека, который любит выпить, но понемногу, или, наоборот, того, кто торгует вином в розлив. Однако первая версия — с проказником и шутником — выглядит более естественной, потому что суффикс -яба редко прикрепляется к предметным названиям, чаще — к глагольным основам.

Сословное происхождение фамилии определить сложно: прозвищные фамилии на -ин встречались и у крестьян, и у посадских людей, и у служилых. Шкалябины могли быть как государственными крестьянами, так и мещанами. В любом случае, фамилия отражает не профессию, а характер — живого, неспокойного человека, который не давал скучать окружающим.