Фамилия Шкибин образована от прозвища Шкиба, в основе которого лежит нарицательное «шкиба», имеющее значение «круглый инструмент для скобления». Возможно, основатель рода Шкибиных был скорняком, выделывающим шкуры, или плотником, пользующимся специальным инструментом для скобления. Однако Шкибами, кроме того, иногда называли людей грубоватых, «неотёсанных». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шкиба, со временем получил фамилию Шкибин.