По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «шкиря», которое в калужских говорах имело значение «окрик на овец». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Шкиря относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть овечьим пастухом. Согласно другой гипотезе, прозвище восходит к украинскому слову «шкiра», то есть «шкура (сырая кожа животного, целиком и с шерстью)». В таком случае предок Шкиря мог быть охотником или кожевенником. Известным представителем фамилии является Игорь Николаевич Шкиря (род. 1965 г.) - народный депутат Верховного Совета Украины.