Фамилия Шкорубская — редкий пример, где географическое происхождение просматривается яснее, чем значение корня. Типичный суффикс -ск- указывает на то, что фамилия образована от названия места, а не от прозвища или профессии. Скорее всего, предок носителя фамилии был либо владельцем, либо уроженцем населённого пункта с основой «Шкоруб-» — например, деревни Шкорубово или хутора Шкорубы.

Корень «шкоруб» — тёмный. В русских говорах нет прямого слова с таким значением. Наиболее вероятная версия: это искажённое или диалектное «скоруб» — от «скорубый», то есть «скорый, быстрый, проворный». В таком случае прозвище Шкоруб могли дать человеку с быстрой речью или резкими движениями, а позже оно закрепилось за целым поселением. Менее правдоподобно связывать фамилию с украинским «шкребти» (скрести) или польским «skórub» — слово редкое и не дающее ясной бытовой картины.

Географически фамилия тяготеет к западу России и востоку Беларуси. Встречается в Смоленской, Псковской областях, а также в Могилёвской и Витебской губерниях по дореволюционным данным. Это регион, где фамилии на -ский нередко носили дворяне и духовенство, но Шкорубские, судя по отсутствию в родословных книгах, скорее принадлежали к крестьянскому или мещанскому сословию — их фамилия просто закрепилась по названию родного хутора.

Написание с «о» после «ш» — «Шкорубская» — основное, но в метрических книгах XIX века встречается вариант «Шкорубский» (мужская форма) и изредка «Скорубская», что подтверждает связь с диалектным «скорубый». В современной России фамилия остаётся редкой: по приблизительным оценкам, её носит не более нескольких сотен человек, в основном на северо-западе страны.