Фамилия Шмагина образована от прозвища Шмага. Оно происходит от украинского глагола «шмагати», т.е. «бить розгами», «резко критиковать, упрекать». Скорее всего, прозвище Шмага указывало на суровый нрав человека. Не исключено, что так могли называть и того, кто постоянно укорял, попрекал других. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шмага, со временем получил фамилию Шмагина.