Фамилия Шмаглюк — яркий пример украинской модели образования фамилий с суффиксом -ук (-юк). Этот суффикс в украинской ономастике указывает на потомка или человека, связанного с тем, что названо в корне: буквально «маленький» или «сын такого-то». В данном случае основа — Шмагл(ь), и фамилия означает «сын или потомок Шмагля».

Корень слова, скорее всего, восходит к украинскому диалектному глаголу «шмагати» — хлестать, стегать, бить прутом. В таком случае «шмаголь» или «шмаглюк» могло быть прозвищем человека с резким, колким характером, либо того, кто занимался плетением или использованием прутьев — например, корзинщика, или же человека, который в быту часто пользовался хворостом. Есть и более прозаичная версия: в некоторых западных говорах «шмага» означала плеть или кнут, так что прозвище могло прикрепиться к вознице или пастуху.

Фамилия распространена на западе Украины, особенно в Тернопольской, Хмельницкой и Ровенской областях, а также среди потомков украинских переселенцев в России и Беларуси. В русском языковом окружении фамилия часто получала ударение на последний слог — Шмаглю́к, хотя исходное украинское произношение может колебаться.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шмаглюк стоит в одном ряду с Шмагало, Шмагун, Шмаглій. Все они образованы от одного гнезда, но разными суффиксами: -ло (по действию), -ун (по склонности), -ій (по качеству). Шмаглюк — самая «молодая» по форме, типичная для фамилий, окончательно оформившихся в XVIII–XIX веках, когда суффикс -ук стал массово вытеснять более старые модели.

В дворянских родословных книгах фамилия не встречается: это крестьянская или казацкая фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали по бытовым, ремесленным или поведенческим чертам. Несмотря на кажущуюся простоту, корень «шмаг» довольно редок, что делает фамилию узнаваемой и не даёт спутать её с более частыми Шмаковыми или Шмальцами.