Фамилия Шмыткин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: основа плюс суффикс принадлежности -ин. Этот суффикс указывает на прямую связь с отцом или главой семьи: Шмытка — так могли прозвать человека, а Шмыткин, соответственно, значит «сын Шмытки» или «человек из рода Шмытки».

Ключ к пониманию фамилии — в прозвище Шмытка. В русских говорах глагол «шмыгать» имел несколько значений. Самое прямое — быстро, юрко двигаться, проскальзывать, часто с оттенком суетливости или скрытности. Человека могли прозвать Шмыткой за его манеру быстро ходить, шмыгать носом или за привычку внезапно появляться и исчезать. Менее распространённое, но тоже возможное значение — «тот, кто шмыгает», то есть трется, шастает без дела.

Есть и вторая, более прозаичная версия, которую поддерживают некоторые исследователи бытовых прозвищ. «Шмыткой» в некоторых регионах называли человека, который постоянно шмыгает носом — простуженного или с хроническим насморком. Такие прозвища по физиологическим особенностям давали часто и без злого умысла, просто как примету.

Суффикс -ин в фамилии Шмыткин указывает на её северное или центральнорусское происхождение. В южных и восточных регионах России чаще использовали суффикс -ов, поэтому фамилии Шмытков встречаются реже, хотя и существуют. Сама фамилия не относится к числу частых, но и не является уникальной — она фиксируется в переписях населения по разным областям, от Псковщины до Урала, что говорит о широком бытовании прозвища в прошлом.

По социальному происхождению носители фамилии Шмыткин, скорее всего, относились к крестьянскому или мещанскому сословию. Фамилии на -ин от прозвищ с бытовой, а не церковной основой — типичный признак непривилегированных слоёв населения, которые получили наследственные фамилии позже дворянства, в XVIII–XIX веках.