Фамилия Шмыткова — женская форма фамилии Шмытков, и её происхождение стоит искать не в географии или дворянских корнях, а в прозвище, которое дали предку. Основа фамилии — «шмыт» или, вероятнее, глагол «шмыгать», «шмытнуть» (то есть быстро двигаться, шмыгать носом или юркнуть куда-то). В русских говорах «шмыт» могло означать либо проворного, непоседливого человека, либо того, кто постоянно шмыгает носом — то есть простуженного или с заложенностью. Вторая версия, менее распространённая, связывает «шмыт» с диалектным словом «шмыток» — так на западе России называли лоскут, обрывок ткани, что могло стать прозвищем портного или бедного человека, ходящего в обносках.

Модель образования простая: суффикс -ов (-ев) присоединился к основе «Шмыт(к)», что типично для русских фамилий, возникших из прозвищ. Форма «Шмытков» — с суффиксом -к-, который в данном случае указывает на уменьшительно-пренебрежительный оттенок: Шмыток — это не просто «шмыт», а «маленький шмыт» или «шмыт-сын». Такая модель характерна для фамилий, которые фиксировали не официальное имя, а бытовое прозвище, данное в семье или деревне. Сравните с однокоренными фамилиями Шмыгин, Шмыганов — все они восходят к тому же глаголу, но с разными суффиксами, что подтверждает живую народную основу.

Географически фамилия Шмытков встречается в основном в центральных и северо-западных регионах России — в Тверской, Псковской, Новгородской областях, а также на Урале, куда переселенцы принесли прозвище. Это указывает на то, что предок Шмытковых мог быть крестьянином или ремесленником из этих мест. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или мещанская: фамилии с суффиксом -ов на прозвищной основе редко встречаются у дворянства, которое чаще брало фамилии от вотчин или служебных званий.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» нет прямого упоминания Шмыткова, но модель «основа на -шмыг- + -ов» разбирается в контексте фамилий от глагольных прозвищ. Единственная спорная версия — связь с немецкой фамилией Schmitt (кузнец) — маловероятна: русское «шмыт» не имеет фонетических параллелей с немецким, и фамилия Шмытков не встречается в регионах с немецким влиянием. Так что правдоподобнее всего — прозвище за шустрого или простуженного человека.