Фамилия Шнычкин образована по модели, характерной для восточнославянских фамилий, с помощью суффикса принадлежности -ин. Он указывает на то, что в основе лежит прозвище или имя, оканчивающееся на -а/-я: Шнычка. Это не крестильное имя, а прозвище, и его значение напрямую связано с глаголом «шнырять» — то есть быстро, суетливо двигаться, рыскать, соваться повсюду, высматривая что-то. В русских говорах «шнык» или «шнычка» — это человек непоседливый, пронырливый, юркий, иногда с оттенком неодобрения (как тот, кто везде сует нос). В. И. Даль в своём словаре фиксирует слово «шнык» именно в значении «шатун, бродяга, кто шныряет».

Интересно, что фамилия Шнычкин не имеет очевидной географической привязки к одной области — она встречается в разных регионах России, но везде достаточно редка. Это говорит о том, что прозвище Шнычка могло возникнуть независимо в разных местностях как характеристика конкретного человека. Поскольку суффикс -ин типичен для северных и центральных русских земель, а в южных и западных регионах чаще использовали -ов/-ев, можно предположить, что ядро фамилии сложилось в зоне владимиро-суздальского или новгородского влияния.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: от прозвища Шнычка (человек со «шныряющей» манерой поведения) через притяжательный суффикс «чей?» — Шнычкин, то есть «сын Шнычки». В отличие от фамилий на -ский или -их, которые часто указывают на дворянское или географическое происхождение, Шнычкин — типичная «прозвищная» фамилия, которая в подавляющем большинстве случаев принадлежала крестьянам или посадским людям. Прямых указаний на ремесло в основе нет — это не профессия, а личная черта.

Встречается вариант написания с одной «н» — Шнычкин, но он не меняет этимологии. Если бы основа была от слова «шнык» (краткая форма), то фамилия могла бы звучать как Шныков — но суффикс -ин указывает именно на форму Шнычка. В ономастике это типичный случай, когда прозвище закрепилось в уменьшительно-ласкательной или пренебрежительной форме, что было распространено в народной среде (ср. Сучкин, Рыбкин, Кузькин). Таким образом, предок носителя фамилии Шнычкин в XVI–XVII веках, скорее всего, получил прозвище за непоседливость или любопытство — и это прозвище пережило века.