Фамилия Штоба — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не славянское. Если отбросить случайные совпадения, корень здесь ищут в немецком языке. Основа — слово Stube, что значит «комната», «горница», а в более широком смысле — «тёплое помещение», «жильё». В русском языке это слово закрепилось в форме «штуба» (или «штуб») для обозначения отапливаемой избы или комнаты, особенно в северных и сибирских говорах.

Модель образования проста: фамилия могла возникнуть как прозвище человека, связанного с таким помещением. Например, хозяина постоялого двора, содержателя тёплой избы для путников, или просто того, кто жил в добротной, просторной горнице. В немецкой традиции фамилия Stube (или Stobbe) тоже встречается, но у нас она могла появиться через переселенцев — немцев Поволжья, Прибалтики или через городских ремесленников, которых приглашали в Россию.

Суффикса -ов или -ин в фамилии нет, она застыла в форме чистой основы. Это характерно для поздних заимствований или для фамилий, которые записывали со слуха, не адаптируя под русские словообразовательные шаблоны. Встречаются варианты написания: Штобба, Штуба, Штоббе. Географически фамилия Штоба редка, искать её стоит в регионах, где были немецкие колонии или активная торговля с немцами — например, в Поволжье, на Урале, в Сибири.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным глаголом «штобать» (шить, стегать) или с польским sztofa (ткань, материя). Но она не подтверждается ни частотой употребления, ни ареалом. Правдоподобнее всего, что предки носителя фамилии Штоба были либо немецкими колонистами, либо русскими людьми, получившими прозвище по роду занятий — содержатель тёплой избы или постоялого двора.