Фамилия Штокова — женская форма фамилии Штоков, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Шток. Самая очевидная версия — связь с немецким словом Stock (палка, ствол, колода). В русских говорах «шток» могло означать «чурбан», «болван» или «неповоротливый человек». Прозвище Шток давали либо плотнику, работавшему с деревянными чурбаками, либо человеку с грузной фигурой или тяжёлым характером.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Штоков буквально «сын Штока». Такая модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда крестьян и посадских людей записывали по отцу. Фамилия не дворянская и не искусственная — она возникла в народной среде, скорее всего, на северо-западе России или в Поволжье, где были сильны немецкие влияния (например, в среде колонистов или через торговые контакты).

Менее вероятная, но встречающаяся в ономастике версия — отчество от краткой формы имени Шток (производное от Штоколд или Штокман, адаптированных немецких имён). В этом случае фамилия указывала бы не на прозвище, а на иностранное происхождение предка. Однако, учитывая, что фамилия Штоков/Штокова встречается в основном в русских регионах (а не в немецких колониях), прозвищная версия надёжнее.

Фамилия редкая. В дореволюционных источниках она не фиксируется среди дворянства или купечества — это фамилия крестьянского или мещанского сословия. В современной России носители Штоковой живут в основном в центральных областях и на Урале. Интересно, что фамилия не имеет однокоренных аналогов с другими суффиксами (вроде Штокин или Штоковский) — это говорит о том, что она возникла локально и не разошлась по разным словообразовательным моделям.