Фамилия Штолина — женская форма фамилии Штолин, и её разбор стоит начать именно с мужского варианта. Штолин — фамилия редкая, и её происхождение напрямую связано с немецким языком. В основе лежит немецкое слово «Stolle» — так в южных и центральных регионах Германии называли ковригу хлеба, каравай, а также небольшой пирог или кекс цилиндрической формы (знаменитый дрезденский штоллен — как раз родственное слово). Соответственно, прозвище Штоль или Штолле могли дать пекарю, булочнику, либо человеку плотного, «круглого» телосложения.

Русский суффикс -ин, присоединённый к немецкой основе, указывает на стандартную модель образования фамилий от прозвищ и названий профессий, оканчивающихся на -а/-я. В данном случае исходная форма могла звучать как Штоля или Штолля — так в быту русифицировали немецкое прозвище. Фамилия Штолин означает «сын (или потомок) Штоли» — то есть человека, которого за глаза называли Булочником или Караваем.

Географически фамилия Штолин (и Штолина) тяготеет к регионам, где в XVIII–XIX веках существовали крупные немецкие колонии: Поволжье, Новороссия, Санкт-Петербургская губерния. Немцы-переселенцы, получая российское подданство, нередко адаптировали свои фамилии под русскую грамматику — добавляли окончания -ов, -ев или -ин. Штолин — как раз такой случай: корень остался немецким, а оформление стало русским. Встречается и вариант Штоллен, но он гораздо реже.

Отдельно стоит упомянуть, что в русском языке слово «штольня» (горная выработка) звучит похоже, но этимологически с фамилией не связано: «штольня» — заимствование из немецкого «Stollen» (стойка, опора), а «Stolle» — совсем другая лексическая ветвь. Так что предки носителей фамилии Штолина — скорее всего, пекари или булочники, а не горняки.