Фамилия Штопина — женская форма фамилии Штопин. В русской традиции такие фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на согласный, и указывают на принадлежность: «чей сын?» — Штопина — «дочь или жена Штопина».

Основа — «штоп» — сразу отсылает к глаголу «штопать», то есть чинить, заделывать дыры на одежде или обуви. Прозвище Штопа или Штопин могли дать человеку, который занимался этим ремеслом: портному, сапожнику, либо тому, кто был особенно аккуратен и терпелив в починке вещей. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от полных крестильных имён, фамилия Штопин — прозвищная, ремесленная. Это значит, что предок носителя фамилии с большой вероятностью был мастеровым человеком, связанным с шитьём или починкой.

Слово «штопать» пришло в русский язык из итальянского (stoppare — «затыкать, конопатить») через немецкое посредничество. Это указывает на то, что фамилия не древняя, а возникла не раньше XVII–XVIII веков, когда ремесленные прозвища стали закрепляться в качестве фамилий. Географически фамилия Штопин встречается в центральных и северных регионах России, где было развито портняжное и сапожное дело. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении: в одном селе или уезде мог жить один род Штопиных, чьё прозвище закрепилось за потомками.

В редких случаях возможна альтернативная версия: если фамилия происходит не от глагола, а от диалектного слова «штопа» — так в некоторых говорах называли затычку, пробку. Тогда прозвище могло относиться к человеку невысокого роста или плотного телосложения. Но ремесленная версия выглядит убедительнее, так как прозвища по занятию были массовыми, а «штопа» в значении «пробка» — узко местное слово.

Фамилия Штопина не имеет отношения к знаменитым дворянским родам. Это фамилия простого сословия: крестьян, ремесленников, мещан. Встречается в записях XIX века, например, в метрических книгах Вятской и Костромской губерний. Сегодня её можно найти по всей России, но чаще всего на Урале и в Поволжье.