Фамилия Шубенцев образована от прозвища Шубенец. Оно, скорее всего, относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род деятельности человека. Поэтому можно предположить, что Шубенцем прозвали мастера по пошиву шуб. Прозвища и фамилии с основой Шуб- встречаются на Руси довольно часто. Менее вероятна связь фамилии Шубенцев с украинским словом «шуб», то есть «приступ психической болезни, после которого наблюдаются изменения личности». В этом случае прозвище Шубенец указывает на болезнь предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шубенец, со временем получил фамилию Шубенцев.