Фамилия Шукшева — женская форма мужской фамилии Шукшев. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Шукша. Сразу стоит отметить, что корень «шукш-» редко встречается в русском именослове, и это делает фамилию особенно интересной для этимологического разбора.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ев присоединяется к основе, оканчивающейся на шипящий или мягкий согласный (в данном случае на -ш). По такой же схеме образованы, например, фамилии Шишев или Шашев. Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Шукшев, то есть сын или потомок человека по прозвищу Шукша.

Самая вероятная версия происхождения основы — от диалектного слова «шукша». В русских говорах, особенно северных и сибирских, так могли называть птицу сойку. Сойка известна ярким оперением и громким, резким криком. Прозвище Шукша могли дать человеку с похожим голосом, пёстрой одеждой или суетливым, беспокойным характером. Подобные «птичьи» прозвища в крестьянской среде были обычным делом — вспомним фамилии Сорокин, Воробьёв, Галкин.

Вторая, менее распространённая версия связывает фамилию с финно-угорскими языками. В коми-зырянском языке есть слово «шуксьыны» — «толкать», «совать». В Поволжье и Приуралье, где издавна соседствовали русские и финно-угорские народы, фамилии с таким корнем могли возникнуть в результате межэтнических контактов. Однако эта гипотеза слабее, так как не даёт ясного объяснения, почему человека назвали бы Шукшей.

Географически фамилия Шукшев (и её женская форма) встречается в основном в центральных и северных областях России, а также в Сибири. Связано это с тем, что прозвище «шукша» — слово диалектное, и носители фамилии, скорее всего, происходят из тех мест, где это слово бытовало в живой речи.

Таким образом, предок современных Шукшевых — человек, которого в своей среде прозвали Шукшей. Скорее всего, за сходство с птицей сойкой: голосом, повадками или внешностью. Фамилия хранит в себе это меткое народное прозвище, вышедшее из активного употребления, но оставшееся в родовом имени.