Фамилия Шукшенцева — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии происхождения. Она образована от названия реки Шукша, а точнее — от прозвища жителя этих мест.

Разбираем словообразовательную модель. В основе лежит топоним Шукша (река в Республике Марий Эл, правый приток Волги) или Шукшеньга (река в Вологодской области). От названия реки образовали прозвище Шукша или Шукшенец — «человек с Шукши». Затем к прозвищу добавили патронимический суффикс -ев-, характерный для фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или -ц. Финальный суффикс -а — женский вариант фамилии. Мужская форма — Шукшенцев.

То есть Шукшенцевы — это потомки человека, которого когда-то прозвали по месту жительства: «выходец с реки Шукши». Такая модель образования (река → прозвище → фамилия) типична для северных и поволжских регионов России. В ономастике этот способ называют «речным»: он дал фамилии Вологжанинов, Пинегин, Мезенцев и, по тому же принципу, Шукшенцев.

Суффикс -ев- указывает на то, что фамилия формировалась в среде, где преобладала «великорусская» модель отчества, а не, скажем, польская на -ский. Это косвенно говорит о крестьянском или мещанском происхождении: дворянские фамилии с такой основой встречаются реже, они скорее тяготели бы к форме Шукшинский.

Спорных версий здесь немного. Можно было бы предположить, что основа Шукш- связана с диалектным глаголом «шукшить» (шептать, шушукаться), но это выглядит натяжкой: прозвище Шукша по глаголу встречается, но суффикс -енц- в таком случае необъясним. Географическая версия проще и подкрепляется реальным существованием рек с таким названием.

Фамилия редкая. Встречается в основном в Поволжье (Марий Эл, Татарстан, Нижегородская область) и на севере (Вологодская, Архангельская области). В документах XVII–XVIII веков могли фиксировать как Шукшенец или Шукшенцов, но современная форма закрепилась с суффиксом -ев.