Фамилия Шукураева — женская форма фамилии Шукураев, и её происхождение почти наверняка ведёт в тюркскую языковую среду. В основе лежит личное имя Шукур (вариант Шукрат), которое восходит к арабскому «шукр» — благодарность, признательность. У мусульманских народов имя Шукур нередко давали в знак благодарности Всевышнему, и оно встречается у татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии. К имени добавили восточный суффикс принадлежности -ай, который в тюркских языках образует ласкательные или уменьшительные формы (сравните: Алтай, Каратай). Получилось имя Шукурай — «благодарный», «тот, кого благодарят». А уже от него по стандартной русской модели образовали фамилию: Шукурай → Шукураев.

Русский суффикс -ев (вместо -ов) появляется после мягких согласных и шипящих, поэтому в фамилии пишется именно «ев», а не «ов». Модель типична для фамилий, которые возникли в среде крещёных татар или других тюркских народов на территории Российской империи в XIX веке, когда фиксация отчества или прозвища по отцу становилась обязательной. Таким образом, первый носитель фамилии Шукураев — это сын человека по имени Шукурай.

Отдельного внимания заслуживает написание. Встречаются варианты Шукураев и Шукураева (женский род), но путаница возможна с фамилией Шукуров, которая образована от того же корня, но без уменьшительного суффикса -ай. Шукуров — более прямая форма («сын Шукура»), а Шукураев подчёркивает ласкательное или прозвищное происхождение. Географически фамилия чаще всего фиксируется в Поволжье (Татарстан, Башкортостан) и на Северном Кавказе, но встречается и в Средней Азии, что связано с миграциями XX века.

Достоверных сведений о дворянском или крестьянском происхождении конкретных ветвей Шукураевых нет — фамилия не относится к числу древних аристократических родов России и, скорее всего, сформировалась в среде сельских жителей или городских ремесленников. В ономастических справочниках (например, в работах А. Суперанской по тюркским фамилиям) корень «шукр» описывается как один из распространённых в мусульманском именослове, но специального разбора именно фамилии Шукураева в известных словарях нет.