Фамилия Шульпекова — женская форма фамилии Шульпеков. Её основа восходит к прозвищу или имени Шульпек, которое встречается в тюркской среде. Словообразовательная модель проста: к основе Шульпек- добавили русский патронимический суффикс -ов (-а), который в XVI–XVII веках закрепился у дворянства, а затем стал стандартным для большинства русских фамилий. То есть носитель фамилии — потомок человека, которого звали Шульпек.

Корень «шульп-» с большой вероятностью связан с тюркским «шуль» — левый, левая сторона. В тюркских языках это слово могло входить в состав личных имён (например, Шульбай) или прозвищ, указывающих на особенность человека — левшу, либо на то, что он родился «под левой рукой» (в переносном смысле — нежеланный или младший). Вторая часть «-пек» — это тюркский титул «бек» (господин, князь) в диалектном произношении. Таким образом, Шульпек может означать «левый бек» или «левша-господин» — прозвище, данное по характерному признаку.

География фамилии указывает на Поволжье и Приуралье. Шульпековы встречаются в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области — в зоне исторического контакта русских и тюркских народов. Это типичная фамилия, возникшая в среде служилых татар или крещёных татар, которые в XVI–XVIII веках переходили на русскую службу и получали фамилии по отцу с русским суффиксом.

В отличие от более распространённых фамилий на -ов, Шульпекова сохраняет редкую основу. В русском языке нет слова «шульпек» или «шульпа», поэтому версия о происхождении от тюркского «шуль» + «бек» — единственная убедительная. Связь с польским «szulpek» (плут) маловероятна: фамилия не фиксируется в западных регионах, а в Поволжье — устойчиво.