Фамилия Шунтуков — редкая и географически локализованная. Её основа — тюркское слово «шунтук» или «шундук», которое в разных тюркских языках (карачаево-балкарском, кумыкском, ногайском) означает «глухой», «закрытый», «замкнутый». В переносном смысле так могли назвать необщительного, молчаливого человека либо того, кто жил в глухом, изолированном месте. Встречается и вариант «шунтук» как обозначение закутка, тупика в овраге — тогда прозвище могло быть топографическим, по месту жительства.

Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления фамилии, характерную для народов Северного Кавказа, где в XIX–XX веках тюркские имена и прозвища адаптировали под русские патронимические окончания. Таким образом, Шунтуков — это «сын (или потомок) Шунтука». Фамилия почти не встречается за пределами Кабардино-Балкарии и Карачаево-Черкесии, что подтверждает её локальное происхождение от родового прозвища.

В отличие от более распространённых кавказских фамилий на -ов, у Шунтукова нет варианта с суффиксом -ев, что говорит о твёрдости конечного согласного основы. Встречающееся изредка написание «Шунтуков» с двойным «т» — скорее всего, ошибка переписи, так как в местных говорах слово произносится с одним глухим согласным.

Анализ показывает: предки носителя фамилии — скорее всего, тюркоязычные горцы (балкарцы или карачаевцы), получившие фамилию по прозвищу. Ни о дворянском происхождении, ни о раннем упоминании в документах говорить не приходится — это фамилия сельская, бытовая, возникшая не ранее середины XIX века, когда у горцев начали массово закрепляться наследственные фамилии.