Фамилия Шваркунов — редкий случай, когда русская модель образования наложилась на основу, звучащую по-немецки, но при этом не имеющую прямого отношения к немецкому языку. Если отбросить суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Шваркуна), мы получаем прозвище Шваркун. Его происхождение неочевидно, и здесь стоит разобрать две основные версии.

Первая и наиболее вероятная версия — звукоподражательная. В русских говорах, особенно северных и сибирских, глагол «шваркать» означал «бросать с шумом», «шлепать», «плескать», а также «говорить резко, грубо». Соответственно, Шваркуном могли прозвать шумливого, неаккуратного в движениях человека или того, кто говорил отрывисто и громко. Суффикс -ун в русском языке как раз образует названия лиц по характерному действию (болтун, крикун, ворчун). В этом случае фамилия чисто славянская по корню, несмотря на созвучие с немецким «шварц» (чёрный).

Вторая версия, более экзотическая, связывает фамилию с немецким Schwarz (чёрный) и полагает, что Шваркун — это русифицированная форма немецкой фамилии Schwarzkopp или Schwarzmann. Однако против этой гипотезы говорит отсутствие в русском языке типичного механизма переделки: от Schwarz ожидали бы Шварцев или Шварцман, но не Шваркун. Появление суффикса -ун здесь трудно объяснить, если только прозвище не возникло как народная переделка непонятного иностранного слова на свой лад.

География фамилии подсказывает, что она не была массовой. Шваркуновы встречаются в Забайкалье, на Урале и в Сибири — то есть в регионах, куда в XVII–XIX веках ссылали или переселяли людей, и где активно смешивались разные диалекты. Возможно, прозвище Шваркун закрепилось за конкретным родом выходцев из северных губерний, где слово «шваркать» было в ходу.

Таким образом, перед нами пример фамилии, которая кажется иноязычной, но с высокой вероятностью образована от русского диалектного глагола. Носитель фамилии Шваркунов — потомок человека, которого в своей среде выделяли за резкость, шумливость или порывистость движений.