Фамилия Сиберко — редкий случай, когда в основе лежит не профессия, не имя, а практически не встречающееся в славянской антропонимии слово. Её разбор сразу ставит вопрос: откуда взялся корень «Сибер-»?

Наиболее вероятная версия — географическая. Фамилия Сиберко могла образоваться от прозвища или названия жителя Сибири. В украинской и белорусской среде, где фамилии на -ко особенно распространены, переселенца или выходца из-за Урала могли прозвать Сибером, а его потомок уже получил фамилию Сиберко. Суффикс -ко в этом случае выступает как уменьшительный или патронимический, то есть «сын Сибера». Такая модель типична для западнорусских земель: ср. Литвинко (от литвин), Москалько (от москаль).

Менее вероятна, но возможна связь с личным именем. В польской ономастике встречается фамилия Siebierski, которую возводят к древнему имени Siebor (от «się» и «bor» — «борющийся»). Русская адаптация могла дать Сиберко, но это скорее экзотика: подобные древнепольские имена почти не сохранились в восточнославянских фамилиях.

География фамилии подтверждает «сибирскую» гипотезу. Сиберко встречается в основном в Украине (особенно в Черниговской и Сумской областях) и в прилегающих районах России. Это регионы, откуда в XVII–XVIII веках активно шли переселенцы в Сибирь, и прозвище «Сибер» могло закрепиться за тем, кто вернулся или чьи предки там побывали. При этом сама фамилия осталась на родине, а не в Сибири.

Формант -ко указывает на украинское происхождение. В русских фамилиях такой суффикс встречается реже, а в польских — почти не встречается. Так что Сиберко — скорее всего, украинская фамилия с прозрачным, хоть и редким, корнем, которая рассказывает о связи предков с огромным краем за Уралом.