Фамилия Синикова — женская форма, а её мужской вариант — Сиников. В центре внимания здесь оказывается суффикс -ов, который указывает на принадлежность: Сиников — буквально «сын Синика» или «из семьи Синика». Но что скрывается за основой «Син-»? В русских фамилиях этот корень встречается нечасто, и его происхождение неочевидно.

Самая вероятная версия связывает фамилию с прозвищем Синяк или Синий. В старину Синяком могли назвать человека с заметной родинкой, синеватым оттенком кожи или просто любителя носить одежду синего цвета. От прозвища Синяк через форму Синик (с уменьшительным суффиксом -ик) и появилась фамилия. Подобные переходы обычны: от Беляк — Беликов, от Черняк — Черников. Так что Сиников — это, скорее всего, «потомок Синяка».

Менее распространённая, но возможная версия — связь с ремеслом или местностью. В некоторых говорах «синикой» могли называть растение синеголовник или даже сорт льна, дающий синеватое волокно. Если предок занимался выращиванием или обработкой такого льна, прозвище Синик могло закрепиться за ним по роду занятий. Однако документальных подтверждений такой трактовки в ономастических справочниках (например, у Б. Унбегауна) нет, это лишь гипотеза.

Географически фамилия Синиковы встречается не повсеместно. Основные очаги — центральные и южные области России, особенно Воронежская и Тамбовская губернии, где распространены фамилии на -иков. Это косвенно подтверждает крестьянское или мещанское происхождение: в этих краях фамилии часто образовывались именно от уличных прозвищ, а не от крестильных имён.

Что касается дворянского сословия — Синиковы в родословные книги не внесены. Фамилия осталась в народной среде, и её носители — это потомки крестьян, ремесленников или однодворцев. Других версий, например, от имени Синисий (редкая форма канонического Синесий), лингвисты не рассматривают из-за отсутствия переходных форм в документах XVII–XVIII веков.