Фамилия Синюкина — женская форма фамилии Синюкин. Её основа — прозвище Синюка, которое в русских говорах имело несколько значений, и все они связаны с синим цветом, чаще всего — с синевой на лице или теле. Человека могли прозвать Синюкой за синяк под глазом, за багровое родимое пятно или за синюшный цвет кожи от болезни или холода. В некоторых диалектах «синюкой» называли пьяницу (от «синий» — сизый нос), а в северных и сибирских говорах — гриб-синяк или ягоду жимолость. Но прозвища от цвета кожи — самый частый случай.

Суффикс -ин в фамилии Синюкин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Синюки, то есть потомок человека с таким прозвищем. Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVIII веков: к основе на -а или -я добавляли -ин, а не -ов. Сравните: Синюка → Синюкин, как Гриша → Гришин или Фома → Фомин. Это одна из самых древних и распространённых схем в центральной и северной России.

Интересная деталь: фамилия Синюкин (и Синюкина) почти не встречается в южнорусских и украинских землях. Её ареал — преимущественно бывшие Владимирская, Костромская, Ярославская и Нижегородская губернии. Там же часто встречаются однокоренные фамилии Синюшин, Синюхин, Синюков — все от того же прозвища Синюка или его вариантов. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель на -ин описывается как характерная для северных и поволжских областей, что косвенно подтверждает географию Синюкиных.

Что касается сословной принадлежности: носители фамилии Синюкин в XIX веке фиксируются среди крестьян и мещан. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала — прозвище слишком простонародное. Но это не делает её «простой»: за ней стоит живое диалектное слово, которое сегодня почти вышло из употребления. Синюка — не имя, а меткая характеристика, которую давали человеку в деревне, и она закрепилась в роду на века.