Фамилия Сисюкин скорее всего образовалась от прозвища Сисюка, в основе которого заложено просторечное «сися», т.е. «женская грудь». В псковских говорах слово «сися» имеет значение «неуклюжий, неопрятный человек». Однако первая гипотеза происхождения этой фамилии представляется более правдоподобной. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Сисюка, со временем получил фамилию Сисюкин.