Фамилия Скарынкин — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа, судя по всему, связана не с общеупотребительным словом, а с диалектным или старым прозвищем. Суффикс -ин указывает на притяжательную модель: Скарынкин — значит «сын Скарынки» или «человек из семьи Скарынки». Такая форма типична для фамилий, образованных от прозвищ или имён с окончанием на -а, -я.

Корень «скарынк-» — тёмный. Можно предположить несколько версий. Первая, наиболее вероятная, отталкивается от диалектного слова «скарынка» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли корку хлеба, горбушку. Человек мог получить прозвище Скарынка за любовь к хлебной корке, за худобу (как «сухарь») или, наоборот, за то, что был главным добытчиком хлеба. Вторая версия — связь с «скара» (от «скаредный» — жадный, скупой), но фонетически переход от «скаред» к «скарынк» маловероятен. Третья — возможная опечатка или вариант фамилии Скорынкин, которая восходит к «скорый» (быстрый, проворный). Но написание через «а» устойчиво, и вряд ли это ошибка писаря.

Географически фамилия Скарынкин встречается фрагментарно, чаще всего в центральных и южных областях России, а также на Украине. Это говорит о том, что основа прозвища могла быть именно диалектной, локальной. В дворянских родословных книгах фамилия не отмечена — скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, закрепившаяся за одной-двумя ветвями рода.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Скарынка, Скарынко, Скарынкин) показывает, что модель образования на -ин — самая распространённая для русского варианта. Украинские аналоги оканчиваются на -ко. Таким образом, предок носителя фамилии Скарынкин был либо русским крестьянином, либо выходцем из украинских земель, получившим прозвище по хлебной корке — простому, но характерному признаку.