Фамилия Скорлыкин — редкий случай в русской ономастике, где прозвище звучит почти как диагноз, но на деле указывает на конкретное ремесло или особенность поведения. Основа фамилии — «скорлыка», слово, вышедшее из обихода, но сохранившееся в диалектах. В псковских и тверских говорах «скорлыкой» называли скорняка — мастера по выделке шкур и меха. Связь прозрачна: в основе лежит глагол «скорлить» (обрабатывать кожу, скоблить, драть), родственный «скоро» (шкура) и общеславянскому «skora». Суффикс -ын- типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а, -я: Скорлыка → Скорлыкин, то есть «сын Скорлыки» или «принадлежащий Скорлыке».

Менее вероятна, но возможна иная версия: «скорлыка» как человек, который «скорлит», то есть быстро и неразборчиво говорит, тараторит. В некоторых говорах «скорлыкать» — болтать без умолку, трещать. Тогда прозвище могло закрепиться за бойким, речистым человеком, а не за ремесленником. Однако с учетом распространенности фамилий, связанных с профессиями (Кузнецов, Плотников, Скорняков), версия со скорняком выглядит убедительнее. Кстати, фамилия Скорняков встречается в разы чаще, а Скорлыкин — её диалектный или фонетический вариант: в живой речи «скорняк» могло превратиться в «скорлыку» через вставку плавного «л».

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России: Псковская, Новгородская, Тверская области. В XIX веке носители Скорлыкиных числились преимущественно среди государственных крестьян и мещан — то есть свободных, но недворянских сословий. В дворянских родословных книгах фамилия не засветилась. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Скорлы́кин, хотя в некоторых семьях могли переставить на последний по аналогии с фамилиями на -ин.

Споров вокруг этимологии почти нет: лингвисты сходятся на прозвищном происхождении от слова, обозначающего либо мастера по коже, либо говорливого человека. Первая версия предпочтительнее, поскольку в русских говорах зафиксировано именно такое значение «скорлыки» — скорняк. Так что предки современного Скорлыкина, скорее всего, выделывали шкуры в деревнях на северо-западе России.