Фамилия Скубачёва — женская форма от мужской Скубачёв, и её происхождение связано с прозвищем или профессией предка. В основе лежит слово «скубач» или «скубан», которое в русских говорах означало того, кто скубёт, то есть дерёт, щиплет, обдирает. В прямом смысле речь могла идти о человеке, который обрабатывал лён или пеньку: скубать — значит очищать волокно от костры, отходов. Такая работа была распространена в крестьянском быту, и прозвище Скубач легко закреплялось за мастером по льну или за тем, кто занимался трепанием и чесанием.

Версия с ремеслом — самая прямая и правдоподобная. Но есть и другая: в диалектах «скубать» также значило «дёргать за волосы», «щипать». Тогда прозвище Скубач могли дать драчуну или задире, который любил хватать за чубы. Оба варианта возможны, но первый — с льняным промыслом — более объясним для целой семьи: профессиональные прозвища чаще становились фамилиями, чем бытовые.

Суффикс -ёв (в мужской форме Скубачёв) вместо более обычного -ов указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий или шипящий звук: Скубач → Скубачёв. Под ударением пишется ё, а не е, что сохраняет произношение предка. Такая модель образования — от прозвища на -ач с добавлением притяжательного суффикса — типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда крестьяне и посадские люди начинали закреплять за собой родовые именования.

Географически фамилия Скубачёв встречается не повсеместно, а тяготеет к северным и центральным областям России, где был развит льняной промысел: Вологодчина, Костромская земля, Ярославль. Встречаются Скубачёвы и в Беларуси, что не удивительно: белорусское слово «скубаць» (щипать, дёргать) также дало прозвища по тому же занятию. В украинских говорах есть параллель «скубати» — с тем же значением.

Мужская форма Скубачёв нередко путают или смешивают с фамилией Скубаев (от «скубай» — тот, кто скубёт), но суффиксы разные: -ев и -ёв. Скубачёв — от основы на -ч, Скубаев — от основы на -й. Это разные ветви одного корня, но не один род.

Фамилия Скубачёва, таким образом, прямо говорит о занятии предка: он обрабатывал лён или, реже, был человеком с неспокойным нравом. В любом случае, это прозвище из живого народного языка, где слово «скубать» сегодня почти забыто, а в XVII веке было обыденным.