Фамилия Созоненко построена по распространенной на востоке Украины модели: суффикс -енко, который в XVI–XVIII веках обозначал сына или ученика человека, названного в основе. То есть Созоненко — буквально «сын Созона». Основа же восходит к каноническому мужскому имени Созонт (от греческого «созон» — спасающий, охраняющий). В бытовой украинской и южнорусской среде это имя часто сокращали до Созон, Созонь, а от него уже и пошла фамилия.

Интересная деталь: имя Созонт в народе иногда путали или сближали с именем Созом (от греческого «созо» — спасаю), но церковная традиция держалась за полную форму Созонт. В святцах есть святой мученик Созонт Помпеопольский, день памяти которого приходится на 7 сентября (20 сентября по новому стилю). Поэтому предки носителей фамилии Созоненко с высокой вероятностью были крещены этим именем, и фамилия закрепилась в тех семьях, где имя Созонт передавалось из поколения в поколение.

Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине и югу России. В переписях XIX века Созоненко чаще всего встречаются в Полтавской, Харьковской и Екатеринославской губерниях. Это указывает на казацкое или крестьянское происхождение: именно в этих регионах суффикс -енко был основным способом образования фамилий у всех сословий, от реестровых казаков до государственных крестьян.

Словообразовательная модель проста: корень Созон- плюс типичный украинский патронимический суффикс. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречались в великорусских землях, Созоненко — маркер именно украинской ономастической традиции. Редкость фамилии объясняется тем, что имя Созонт никогда не было частотным: оно уступало по популярности Иванам, Петрам и Василиям, поэтому и производных от него фамилий значительно меньше.

Если сравнивать с однокоренными, то можно вспомнить фамилию Созонов (русский вариант с суффиксом -ов) или Созонтьев (от полной формы имени). Созоненко стоит особняком как украинская форма, сохранившая старую патронимическую конструкцию без дополнительных суффиксов.