Фамилия Спиратов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Если отбросить очевидную, но ложную ассоциацию со спиралью (слово пришло в русский язык поздно, через научную лексику, и вряд ли стало основой для прозвища), остаётся несколько версий, и самая вероятная связана с церковным именем Спиридон.

В основе фамилии лежит каноническое греческое имя Спиридон (Σπυρίδων), которое в просторечии часто сокращали и переделывали. От него образовались десятки вариантов: Спиридонов, Спирин, Спиркин, Спиронов. Спиратов мог возникнуть из формы Спират — так могли называть в быту Спиридона (сравните: Спиридон → Спиря → Спира → Спират). Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Спирата». Такая модель образования — от разговорного, «уличного» варианта имени — характерна для русских фамилий XVI–XVII веков.

Менее распространённая, но допустимая версия — связь с прозвищем Спира. В южнорусских и украинских говорах «спирать» означало «сжимать, давить, теснить». Прозвище Спира мог получить человек упрямый, настойчивый или, наоборот, тот, кто работал с тисками, прессом, например, кузнец или бондарь. Однако этот корень дал бы скорее фамилию Спирин, а не Спиратов.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России, встречается в старых переписях Воронежской, Тамбовской и Рязанской губерний — как раз там, где имя Спиридон было особенно популярно среди крестьян и мещан. В дворянских родословных Спиратовы не значатся: это фамилия людей простого сословия, получивших её по отцу или деду, носившему обиходное имя Спират.