Фамилия Спиридонковкина — редкий случай, когда в одном слове уместились сразу три суффикса. Её основа — каноническое имя Спиридон (от греческого «корзиночка», но в народе чаще связывали с духом или верой). К имени добавили уменьшительный суффикс -к-, получив форму Спиридонка — так в быту называли ребёнка или взрослого, но с оттенком простоты или ласки. Затем пошла отыменная модель: от Спиридонки образовали притяжательное прилагательное Спиридонков (чей? — сын Спиридонки), а от него — фамилию с типичным русским суффиксом -ин: Спиридонковин. Но на этом цепочка не оборвалась: к основе прирос ещё один суффикс -к-, и получилась форма Спиридонковкин — уже как вторая ступень уменьшительности или вариант, закрепившийся в документах из-за двойной записи. Финальное -а указывает на женскую форму, то есть перед нами фамилия женщины по мужу или отцу.

Такая громоздкая структура — редкость. Обычно фамилии с двойным суффиксом (-ов + -ин) встречаются в северных и центральных губерниях России, где крестьянские прозвища и отчества записывали «на слух» и могли прибавить лишнее окончание, чтобы отличить ветвь рода. Спиридонковкина, скорее всего, возникла в среде, где имя Спиридон было частым, а местный говор или почерк писаря добавили лишнее «колено». Географически такие фамилии чаще встречаются в Вологодской, Архангельской или Костромской областях — там, где сохранялись архаичные формы словообразования.

Правдоподобная версия: предок носителя фамилии был Спиридоном, его сына в деревне звали Спиридонкой, а внука — уже Спиридонковкиным, то есть «внуком Спиридонки». Это не ремесло и не прозвище по характеру, а чисто родовая метка: кто ты по отцу и деду. В отличие от фамилий на -ский, которые часто указывали на владение землёй или происхождение из села, Спиридонковкина — крестьянская, «длинная» фамилия, которая в XIX веке могла сократиться до Спиридонков или Спиридонкин, но по какой-то причине сохранилась в полном виде.

В современных справочниках фамилия почти не встречается — это штучный экземпляр, который говорит о том, что род был немногочисленным или жил в изоляции. Если вы носите эту фамилию, скорее всего, ваши предки были крестьянами из северной или центральной России, а имя Спиридон передавалось в семье через поколение.